뒤쥐는 땃쥐, 갯첨서와 같은 첨서목(Soricomorpha) 첨서과(Soricidae)에 속하는 포유류이다. 뒤의 중세어형은 ‘뒤ㅎ’이며, 향하고 있는 방향과 반대되는 쪽이나 곳 또는 보이지 않는 곳을 뜻하므로, 뒤쥐는 ‘보이지 않는 쥐’라 추정할 수 있다. 뒤쥐의 학명에서 Sorex는 그리스어 hurax에서 유래한 라틴어 땃쥐(Shrew)를 의미하며, 라틴어 caecus는 ‘시각장애의(blind)’란 뜻을 가지고 있어 Caecutius은 ‘잘 볼 수 없는(seeing badly)’으로 풀이할 수 있다. 뒤쥐는 눈이 작고, 먹이를 사냥할 때 긴 주둥이 끝에 있는 코를 활발하게 이용하므로 과거에 생김새를 볼 때 앞을 잘 볼 수 없는 것으로 추정하여 학명을 정한 것으로 판단된다.