Basic Local Alignment Search Tool의 약자로, DNA 염기서열 또는 단백질의 아미노산 서열을 서로 비교하기 위한 연산법(algorithm) 입니다. BLAST는 현재 생물학 분야의 프로그램 중에서 가장 많이 활용되는 핵심 프로그램이며, 대용량의 서열과 입력서열을 비교하여 가장 유사한 서열을 검색 할 수 있습니다. 실질적으로 뉴클레오티드- 뉴클레오티드, 단백질- 뉴클레오티드, 단백질-단백질, 뉴클레오티드-단백질 등의 질의-데이터 베이스 쌍에 대한 버전을 가지고 있는 여러 버전의 프로그램 집합입니다.서열이 염기로 구성된 서열(nucleotide sequence)이 input일 경우, blastn, tblastx, blastx를 이용하고, 단백질로 구 성된 서열(Protein sequence)이 input일 경우, blastp, tblastn을 이용합니다.

한반도의 생물다양성에서 제공하는 BLAST는 염기서열의 비교인 BlastN을 사용하여 입력서열을 국립생물자원관 데이터베이스의 서열과 비교할 수 있습니다.